十八、秘密保持命令或偵查保密令案件之卷宗歸檔時，如卷附營業秘密，承辦人員應於歸檔專用封套封口加註歸檔日期簽章後，送檔案管理單位辦理歸檔。 附有營業秘密之秘密保持命令或偵查保密令案件之裁定原本，於歸檔時，應依前項規定辦理。
根據上述資料，法院辦理秘密保持命令及偵查保密令案件的作業要點第18條規定，在卷宗歸檔時，如果卷宗中有營業秘密相關的文件，承辦人員應將卷宗放入歸檔專用封套中，在封口處加註歸檔日期後簽章，然後送交檔案管理單位進行歸檔。 這表示當有秘密保持命令或偵查保密令案件涉及營業秘密時，法院在將這些案件進行歸檔時，必須注意保護營業秘密的機密性。這樣的規定可以確保營業秘密的機密性得到適當的保護。
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