許可文件之登記事項有變更者，應填具申請書，檢附許可文件及第三條所定文件、資料，向中央主管機關申請變更登記，並繳納審查費；其應換發新證者，並應繳納證書費。
根據食品與相關產品查驗登記及許可文件管理辦法第6條的規定，許可文件的登記事項如有變更，應填具申請書，檢附許可文件及相關文件和資料，向中央主管機關申請變更登記，同時需支付審查費用；若需要換發新證書，則還需支付證書費用。 舉例：甲公司持有特定食品的許可文件，但三年後成分、原料或其他登記事項有所變更，為了使許可文件合乎法規，甲公司需填寫申請書，檢附相關文件及資料向中央主管機關申請變更登記，同時支付審查費用。如果需要換發新證書，還需要支付證書費用。
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