本法施行前第一審法院就應適用簡易訴訟程序之智慧財產民事事件，誤行通常訴訟程序者，經上訴或抗告，其卷宗已送達上訴或抗告法院者，於本法施行後，第二審法院應依本法所定第二審程序終結之。
根據智慧財產案件審理法施行細則第4條規定，如果在智慧財產民事事件的第一審中，法院錯誤地採用了通常訴訟程序，並且在上訴或抗告期間，卷宗已經送達給上訴或抗告的法院，則在智慧財產案件審理法施行後，第二審法院應該按照智慧財產案件審理法规定的第二審程序結案。 例如，假設在該法施行前，涉及智慧財產民事事件的第一審法院誤用通常訴訟程序進行審理，而在後續的上訴或抗告期間，卷宗已經送達給上級法院。那麼，當智慧財產案件審理法施行後，第二審法院應該根據該法所定的第二審程序進行結案，以確保在智慧財產民事事件中使用適當的訴訟程序。
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