蘇澳支局掌理轄區進出口貨物之通關、查緝等事宜。分設三股、巡緝艇，各股及巡緝艇之職掌如左： 一、總務股： (一) 會計、出納之處理。 (二) 進出口貨棧、報關行、運輸業之設立登記及管理。 (三) 一般行政管理事項。 二、業務股： (一) 進出口通關業務。 (二) 進出口報單及艙單之管理。 (三) 進出口貨物之查驗。 三、稽查股： (一) 進出口船舶通關之管理。 (二) 轄區巡緝業務之執行。 (三) 進出口貨棧之監管。 (四) 進出口貨物之查驗。 (五) 出、入境旅客及船員行李之檢查。 (六) 關艇之指揮管理。 四、巡緝艇： (一) 勤務規劃。 (二) 船體艙面設備及航海儀器之保養與維護。 (三) 通商口岸 (包括港區、錨地及其臨近水域) 巡緝及港區工作船臨檢等事項。 (四) 輪機設備之保養與維護。
根據財政部基隆關稅局辦事細則第22條，該辦事細則分設了總務股、業務股、稽查股和巡緝艇。其中，業務股負責進出口通關業務、進出口報單及艙單的管理，以及進出口貨物的查驗。而稽查股負責進出口船舶通關的管理、轄區巡緝業務的執行、進出口貨棧的監管，以及進出口貨物的查驗等事項。巡緝艇則負責勤務規劃、船體艙面設備和航海儀器的保養與維護，以及通商口岸巡緝和港區工作船臨檢等事項。 參考資料： - 財政部基隆關稅局辦事細則 - 財政部基隆關稅局網站
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