會計室掌理歲計、會計及兼辦統計等事宜。分設三股，各股之職掌如左：一、第一股： (一) 本局及所屬支局歲入預算之控管。 (二) 歲入決算編製。 (三) 歲入類原始憑證之審核。 (四) 歲入類記帳憑證之造具。 (五) 歲入類會計簿籍之登載。 (六) 歲入類會計報表之編造。 (七) 歲入類會計檔卷之整理及保管。 (八) 有關徵課會計制度之研擬及推行。 (九) 其他有關歲入會計事項。 (十) 兼辦一般公務統計事項。 二、第二股： (一) 本局及所屬支局歲出預算之控管。 (二) 歲出決算之編製。 (三) 經費類原始憑證之審核。 (四) 經費類記帳憑證之造具。 (五) 經費類會計簿籍之登載。 (六) 經費類會計報表之編造。 (七) 經費類會計檔卷之整理及保管。 (八) 其他有關歲出會計事項。 二、第三股： (一) 本局及所屬支局歲出、入概算之彙編。 (二) 本局及所屬支局預算執行之監督、審核。 (三) 會計憑證之事後查核及送審。 (四) 有關現金、有價證券、保管品及財產物品之檢查。 (五) 營繕工程、類物購置、定製、變賣之監辦。 (六) 財產統制帳之登載及處理。 (七) 內部檢查之執行。 (八) 其他行政事項之辦理。
財政部臺中關稅局辦事細則第 14 條規定了會計室的職掌，分為三個股，各股的職掌如下： 第一股： 1. 控制本局及所屬支局的歲入預算。 2. 編製歲入決算。 3. 審核歲入類的原始憑證。 4. 造具歲入類的記帳憑證。 5. 登載歲入類的會計簿籍。 6. 編造歲入類的會計報表。 7. 整理和保存歲入類的會計檔卷。 8. 研究和推行徵課會計制度。 9. 其他有關歲入會計事項。 10. 兼辦一般公務統計事項。 第二股： 1. 控制本局及所屬支局的歲出預算。 2. 編製歲出決算。 3. 審核經費類的原始憑證。 4. 造具經費類的記帳憑證。 5. 登載經費類的會計簿籍。 6. 編造經費類的會計報表。 7. 整理和保存經費類的會計檔卷。 8. 其他有關歲出會計事項。 第三股： 1. 彙編本局及所屬支局的歲出和歲入概算。 2. 監督和審核本局及所屬支局的預算執行。 3. 事後查核和送審會計憑證。 4. 檢查現金、有價證券、保管品和財產物品。 5. 監辦營繕工程、類物購置、定製和變賣。 6. 登載和處理財產統制帳。 7. 執行內部檢查。 8. 其他行政事項的辦理。 根據行為時商業會計法第 13 條，所得稅法第 83 條及同法施行細則第 13 條規定，會計室應遵循商業會計法和一般公認會計原則的規定來處理會計事項，並且應按發生次序逐日登帳，不得超過二個月。 此外，財政部依該條所訂定的商業會計處理準則第 2 條中明確要求按照法令的規定辦理會計事項。會計室還應根據稅務行政法及所得稅法的相關規定辦理所得稅計算及申報事項。 參考資料: 1. 商業會計法 2. 商業會計處理準則 3. 所得稅法 4. 所得稅法施行細則 5. 財政部相關函釋文件
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