第三組分設三科，各科掌理事項如左： 一、第一科： （一）關於飲用水、地面水、地下水、水污染源放流水、海水中各類污染物檢測方法之研訂、修正及解釋事項。 （二）關於不屬本組其他各科之事項。 二、第二科： （一）關於飲用水、地面水、地下水、水污染源放流水、海水中有機物檢測之執行事項。 （二）關於飲用水、地面水、地下水、水污染源放流水、海水中有機物檢測品質保證、品質管制之執行事項。 三、第三科： （一）關於飲用水、地面水、地下水、水污染源放流水、海水中無機污染物檢測之執行事項。 （二）關於飲用水、地面水、地下水、水污染源放流水、海水中無機污染物檢測品質保證、品質管制之執行事項。
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