書記官應妥善保管營業秘密案件之訴訟資料或卷證，其經法院裁定不予准許或限制閱覽（檢閱）、抄錄、攝影或以其他方式重製者，應抽離置於另行編定之限閱卷宗及其證物袋內或裝箱外放，並於限閱卷宗封面或外箱為適當註記。 書記官受理閱卷聲請時，就不予准許閱卷部分，不得交閱；就限制閱卷部分，應依第一項裁定意旨，以遮隱或去識別化等方式處理後，始得交閱。前項閱卷，除電子卷證外，應有書記官或專責人員在場，並在專區或指定之地點為之。
對於法院辦理營業秘密案件閱卷及不公開審判辦法第6條，根據上述參考資料，該條規定了書記官應如何處理營業秘密案件的訴訟資料或卷證，當法院裁定不予准許或限制閱覽、抄錄、攝影或以其他方式重製時，應將其抽離置於特定的限閱卷宗或外箱內，并適當註記。在受理閱卷聲請時，對於不准許閱卷部分，書記官不得交閱；對於限制閱卷部分，應經處理後方可交閱，且需有書記官或專責人員在場監督。 這項規定的目的是為了保護營業秘密的機密性，並避免泄露敏感資訊。例如，在參考資料中提到的一個案例中，有關公司的營業秘密涉及了關鍵的技術資訊和成本數據，因此在訴訟過程中需要限制相關訴訟資料的閱覽，以保障企業的權益。
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