運輸署之承運權限如下：
一、依據補給計畫，動 (復) 員計畫，部隊機動 (調防) 訓練計畫，訂頒人員與補給品之配運計畫。
二、核發超過地區運輸單位承運權限之運輸許可。
三、接受外島及作戰區之運輸申請。
四、接受或臨時專案部隊人員、裝備、軍品之運輸申請。
五、接受部隊一旅、軍品八百零一噸、車輛五十一輛以上之運輸申請。
鐵路軍事運輸作業規則 第二節 承運權限
§ 6–8共 3 條
陸軍各地區運輸單位，負責執行配運計畫或運輸許可核定範圍之運輸。
地區運輸單位及所屬駐站運輸軍官之承運權限如下：
一、執行配運計畫或運輸許可核定範圍之運輸。
二、擔任港口清運作業，及國外物資第二階段接運。
三、各地區運輸單位，有承運一個旅以下部隊，駐站運輸軍官有承運一營以下部隊 (均含裝備) 之鐵運權。
四、各地區運輸單位，有承運八百噸以下軍品或五十輛以下車輛；駐站運輸軍官有承運四百噸以下軍品或二十輛以下車輛之鐵運。
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