主任委員綜理會務，並指揮監督所屬單位及職員；副主任委員襄助主任委員處理會務。
行政院大陸委員會辦事細則 第三章 權責
§ 15–22共 8 條
主任秘書承長官之命，處理業務，其權責如左：
一、各處、室文稿核判。
二、機密文件撰擬。
三、長官授權文件代判。
四、計畫報告核閱處理。
五、各處、室業務之協調及權責劃分之核議。
六、主管業務之接洽、協調及參加有關會議。
七、長官交辦事項。
處長、室主任承長官之命，處理本處、室業務，其權責如左：
一、主管業務之規劃、執行、指導、監督及考核。
二、案件文稿工作分配、擬辦及審核。
三、長官授權文件代判。
四、主管範圍內有關法令規章之研擬。
五、主管範圍內各種重要業務報告及審核。
六、主管業務之接洽、協調及參加有關會議。
七、本處、室日常業務處理。
八、長官交辦事項。
各級人員因事不能執行職務時，應依規定指定或委託適當人員代理，代理人就代理職務負其責任。
本會實施分層負責，分層負責明細表另定之。
各處、室依分層負責明細表所列權責代判之文稿或以處、室名義決行之文件，由代判人或決行人員負其責任。
各處、室處理事務涉及其他處、室職掌者，應會商辦理。如意見不同或有疑義時，陳由主任委員或副主任委員核定；各科意見不同或有疑義時，由該處、室主管決定。
各級人員處理事務，依左列規定負其責任：
一、超出代行範圍者，由核判人員負責。
二、重要案件處理錯誤或失當者，除由承辦人員負責外，審核人員及主管人員負連帶責任。
三、普通文件處理錯誤或失當者，由承辦人員負責。
四、引用人名、地名、機關名稱、公文字號、數字錯誤者，由承辦人員負責。
五、會計、統計數字錯誤者，由承辦人員負責；其關係重大者，審核人員及主管人員負連帶責任。
六、引用法令、案例或行文手續錯誤者，由承辦人員負責；其關係重大者，審核人員及主管人員負連帶責任。
七、文件繕、校錯誤者，由繕、校人員負責；蓋印錯誤者，由蓋印人員負責；收發錯誤者，由收發人員負責；其關係重大者，主管人員負連帶責任。
八、款項、物品收發之遺漏或錯誤者，由經手收發人員負責；其關係重大者，主管人員負連帶責任。
九、財產處理錯誤者，由承辦人員負責；其關係重大者，主管人員負連帶責任。
十、處理錯誤或失當之文件，經會簽者，會簽人員應共同負責。
十一、無正當理由積壓文件而致延誤者，除由承辦人員負責外，主管人員負連帶責任。
十二、其他事項之錯誤，依職掌之規定分別負責。
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