徵收案件之申請程序如下： 一、需用土地人為中央機關、直轄市或縣（市）政府者，逕送中央主管機關核定。 二、需用土地人為中央機關所屬機關者，應經其上級機關核轉中央主管機關核定。 三、需用土地人為鄉（鎮、市）公所者，應經該管縣（市）政府核轉中央主管機關核定。 四、需用土地人為農田水利會者，應經該管縣（市）政府報經中央目的事業主管機關核轉中央主管機關核定。
根據土地徵收條例施行細則第15條，土地徵收案件的申請程序如下： 1. 如果需用土地人是中央機關、直轄市或縣（市）政府，則直接向中央主管機關提出申請，由其核定。 2. 如果需用土地人是中央機關所屬機關，則應經其上級機關核轉後，再向中央主管機關提出申請，由其核定。 3. 如果需用土地人是鄉（鎮、市）公所，則應經該管縣（市）政府核轉後，再向中央主管機關提出申請，由其核定。 4. 如果需用土地人是農田水利會，則應經該管縣（市）政府報經中央目的事業主管機關核轉後，再向中央主管機關提出申請，由其核定。 舉例來說，如果某個鄉鎮公所需要徵收土地，他們應該先向所在的縣市政府申請核轉，然後再向中央主管機關提出申請進行核定。
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