各地區巡防局，掌理下列事項︰ 一、執行入出海岸管制區之檢查、管制事項。 二、執行海岸、非通商口岸之查緝走私、防止非法入出國事項。 三、協助執行通商口岸之查緝走私、防止非法入出國事項。 四、執行船舶及其他水上運輸工具非法進入海岸地區之管制及處理事項。 五、執行海岸犯罪之偵防及警衛、警戒等事項。 六、執行海岸及漁、商港之安全檢查事項。 七、執行海岸涉外事務之協調、調查及處理事項。 八、維持通信、電子（含雷達）、光電、資訊等設施、系統運作及電（網）路調整建議等事項。 九、執行查緝走私、防止非法入出國及反滲透情蒐等事項。 十、其他依法應執行或協助之事項。
根據《行政院海岸巡防署海岸巡防總局各地區巡防局組織通則第 3 條》，各地區巡防局負責以下事項： 1. 執行入出海岸管制區的檢查和管制工作。 2. 执行海岸和非通商口岸的查缉走私、防止非法入出国工作。 3. 协助执行通商口岸的查缉走私、防止非法入出国工作。 4. 執行船舶及其他水上运输工具非法进入海岸地区的管制和处理工作。 5. 執行海岸犯罪的侦防、警卫、警戒等工作。 6. 執行海岸和港口的安全检查工作。 7. 執行海岸涉外事务的协调、调查和处理工作。 8. 维护通信、电子（包括雷达）、光电、信息等设施、系统运作和电（网）路调整建议等工作。 9. 執行查缉走私、防止非法入出国和反渗透情报收集等工作。 10. 其他依法应执行或协助的事项。 這些規定涵蓋了海岸巡防局在海岸巡防工作中的職掌和權限。例如，在第二項中，巡防局負責查緝走私、防止非法入出國的工作；在第三項中，巡防局協助執行通商口岸的查緝走私、防止非法入出國的工作。這些事項的具體內容和執行方式可能還需要參考其他相關法規和指導文件才能進一步確定。
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