檢查管制科掌理事項如下： 一、關於港口安全檢查施政計劃之擬訂、督（指）導暨管制執行事項。 二、關於通商口岸（商港）、工業專用港、遊艇港、漁港安檢勤務之指導、考核，及出入人員、物品與運輸工具安全檢查規定之擬訂事項。 三、關於商、客、貨輪進出商港（工業港）及漁船筏（民）進出漁港，涉嫌走私、偷渡（非法入出國）及相關犯罪案件之處理事項。 四、關於商港、工業專用港、遊艇港、漁港安檢所之增設或裁撤事項。 五、關於安檢裝備需求、研發及養護之指導事項。 六、關於查核進出港船舶載運械彈。 七、關於商港、漁港安檢法令之彙編、研修、釋疑、測驗、講習及商檢工作重大案例編撰事項。 八、關於商港、漁港安檢工作各項資料之統計、分析及運用事項。 九、關於配合主政機關辦理商港、工業專用港、遊艇港、漁港港安演習之策劃、指導相關事項。 十、關於人民、機關、團體及學校申請進出港事項。 十一、關於協助大陸船員岸置事務之督（指）導事項。 十二、關於協助傳染性疫病防處之勤務督（指）導事項。 十三、關於安檢單位年節慰問金及個案慰問之簽處事項。 十四、有關商港、漁港安檢勤務與緝私專案相關工作之處理及執行事項。
根據行政院海岸巡防署海岸巡防總局北部地區巡防局辦事細則第 9 條的規定，檢查管制科掌理的事項包括： 1. 擬訂、督導和執行港口安全檢查施政計劃。 2. 擬訂通商口岸（商港）、工業專用港、遊艇港、漁港的安檢規定，並指導和考核出入人員、物品以及運輸工具的安全檢查。 3. 處理商、客、貨輪進出商港（工業港）以及漁船筏的走私、偷渡和其他相關犯罪案件。 4. 增設或裁撤商港、工業專用港、遊艇港、漁港的安檢所。 5. 指導安檢裝備的需求、研發和養護。 6. 查核進出港船舶是否載運械彈。 7. 彙編、研修、釋疑、測驗、講習商港、漁港的安檢法令，並編撰重要的安檢案例。 8. 統計、分析和運用商港、漁港的安檢工作相關資料。 9. 策劃和指導相關事項，以協助主政機關辦理商港、工業專用港、遊艇港、漁港的港安演習。 10. 處理人民、機關、團體和學校申請進出港的事項。 11. 監督和指導協助大陸船員岸置事務。 12. 監督和指導協助傳染性疫病防處的工作。 13. 簽處安檢單位年節慰問金和個案慰問事項。 14. 處理和執行與商港、漁港的安檢勤務和緝私專案相關的工作。 參考資料：行政院海岸巡防署官網、相關法律規定和法規文件。
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