資訊室掌理資料處理事項。分設三股，各股之職掌如左： 一、第一股： (一) 進口通關作業系統之作業輔導與執行。 (二) 進口貨物通關自動化相關作業事項之推動與執行。 (三) 人事薪資、保證金處理、法務、保稅稽銷、徵課會計、查緝走私情報等系統之研究發展與作業執行。 (四) 旅客通關各項系統之研究發展與作業執行。 (五) 資訊作業使用者識別碼及程式安全控管。 (六) 其他有關通關作業交辦事項。 二、第二股： (一) 電腦週邊設備及通訊網路之管理及維護。 (二) 旅客通關各項系統之研究發展與作業執行。 (三) 本局主機系統檔案之備授與使用管制。 (四) 電腦機房環境與機器設備之管理維護。 (五) 電腦及其相關設備耗材之控管事項。 (六) 端末機及端末印表機之調配管制。 (七) 電腦相關設備租購事宜。 (八) 其他有關硬體設備交辦事項。 三、第三股： (一) 出口通關作業系統之作業輔導與執行。 (二) 出口貨物通關自動化相關作業事項之推動與執行。 (三) 公文管理、樣品管理、出口商標、緝案等系統之研究發展與作業執行。 (四) 旅客通關各項系統之研究發展與作業執行。 (五) 報關磁卡製作及控管。 (六) 年度關務資訊計畫需求審議。 (七) 資訊作業有關年度概算之編製。 (八) 資訊稽核及災變計畫之配合執行。 (九) 一般行政管理及其他交辦事項。
根據財政部臺北關稅局辦事細則第13條，資訊室分設三股，分別負責不同的業務。以下是各股的職掌： 第一股： 1. 輔導與執行進口通關作業系統。 2. 推動與執行進口貨物通關自動化相關作業事項。 3. 研究發展與作業執行人事薪資、保證金處理、法務、保稅稽銷、徵課會計、查緝走私情報等系統。 4. 研究發展與作業執行旅客通關各項系統。 5. 負責資訊作業使用者識別碼及程式安全控管。 6. 處理其他相關通關作業交辦事項。 第二股： 1. 管理及維護電腦週邊設備及通訊網路。 2. 研究發展與作業執行旅客通關各項系統。 3. 備授與使用管制本局主機系統檔案。 4. 管理維護電腦機房環境與機器設備。 5. 控管電腦及其相關設備耗材。 6. 調配管制端末機及端末印表機。 7. 處理電腦相關設備租購事宜。 8. 處理其他相關硬體設備交辦事項。 第三股： 1. 輔導與執行出口通關作業系統。 2. 推動與執行出口貨物通關自動化相關作業事項。 3. 研究發展與作業執行公文管理、樣品管理、出口商標、緝案等系統。 4. 研究發展與作業執行旅客通關各項系統。 5. 負責報關磁卡製作及控管。 6. 審議年度關務資訊計畫需求。 7. 編製資訊作業有關年度概算。 8. 配合執行資訊稽核及災變計畫。 9. 處理一般行政管理及其他交辦事項。 以上職掌的內容可參考財政部臺北關稅局辦事細則第13條所列，這些股的責任範圍涵蓋了不同的業務領域，包括通關作業系統、旅客通關、資訊安全控管、硬體設備管理等。資料處理事項是資訊室的主要職責之一，並且根據所列明的作業內容，可以確定不同股的業務範疇。 依據最新的資料，這些業務項目與財政部臺北關稅局辦事細則第13條的職掌一致。例如，第一股的作業輔導與執行進口通關、推動與執行進口貨物通關自動化等，符合該條所規定的職掌內容。
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