員工薪津由第六課出納人員，依據員工異動通知單編造清冊，職員送人事室，工友送第六課核對後，再送會計室分別審核，呈分局長核定後，交會計室編製傳票或付款憑單送第六課出納人員轉發，並扣繳法定稅捐。
根據經濟部商品檢驗局基隆分局辦事細則第39條，員工的薪津流程如下： 1. 第六課的出納人員根據員工異動通知單編造清冊。 2. 職員的清冊送交給人事室，工友的清冊送交給第六課核對。 3. 核對無誤後，再送交會計室進行審核。 4. 經過會計室審核後，呈交分局長核定。 5. 分局長核定後，將相關資料交給會計室編製傳票或付款憑單。 6. 由第六課的出納人員轉交傳票或付款憑單，並扣繳法定稅捐。 以最新資料為例，經濟部商品檢驗局基隆分局辦事細則於105年11月8日修正，修正後的內容可參考該細則的最新版本。
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