動物防疫組分設四科，各科掌理下列事項： 一、獸醫行政科： （一）獸醫師管理政策、法規、方案、計畫之擬訂、策劃、執行及督導。 （二）獸醫師之登記、管理及訓練。 （三）獸醫師團體之輔導、交流、聯繫及監督。 （四）寵物與野生動物防疫政策、法規、方案、計畫之擬訂、策劃、執行及督導。 （五）寵物與野生動物防疫技術、程序、方法之研擬、執行及督導。 （六）寵物與野生動物防疫科技之研究、發展、引進及技術服務。 （七）獸醫有關科技應用之研究、發展、引進及技術服務。 （八）其他獸醫行政事項。 二、家畜防疫科： （一）家畜防疫政策、法規、方案、計畫之擬訂、策劃、執行及督導。 （二）家畜防疫科技之研究、發展、引進及技術服務。 （三）家畜防疫技術、程序、方法之研議、執行及督導。 （四）家畜疫病疫情管制業務之策劃、分析、聯繫及督導。 （五）動物防疫相關國際合作、交流及國際事務之處理。 （六）化製場之管理及督導。 （七）其他有關家畜防疫事項。 三、家禽及水生動物防疫科： （一）家禽與水生動物防疫政策、法規、方案、計畫之擬訂、策劃、執行及督導。 （二）家禽與水生動物防疫科技之研究、發展、引進及技術服務。 （三）家禽與水生動物防疫技術、程序、方法之研議、執行及督導。 （四）家禽與水生動物疫病疫情管制業務之策劃、分析、聯繫及督導。 （五）動物防疫資訊系統之擬訂、策劃、執行及督導。 （六）其他有關家禽及水生動物防疫事項。 四、藥品管理科： （一）動物用藥品與動物衛生資材管理政策、法規、方案、計畫之擬訂、策劃、執行及督導。 （二）動物用藥品與動物衛生資材檢驗之策劃、執行及督導。 （三）動物用藥品科技之研究、發展、引進及技術服務。 （四）動物用藥品製造、輸出入、販賣、使用、品質檢驗、證照核發之審核、管理及督導。 （五）動物用藥品使用準則、試驗基準、品質規格與檢驗標準之擬訂、審議及督導。 （六）畜禽藥物殘留之監測與檢驗技術開發之研擬、策劃及督導。 （七）動物用藥品與動物衛生資材相關國際合作、交流及國際事務之處理。 （八）其他有關動物用藥品管理事項。
從上述法條中，可以了解到農委會動植物防疫檢疫局的組織架構和各科的職責分工。獸醫行政科負責獸醫師相關事項，包括管理政策、法規、訓練等；家畜防疫科負責家畜防疫政策、研究、疫病管制等；家禽及水生動物防疫科則負責家禽和水生動物防疫相關事務；藥品管理科則負責動物用藥品和動物衛生資材管理相關事項。 針對動植物防疫檢疫局辦事細則第 5 條，首先我們來關注其中的「家禽及水生動物防疫科」，根據該條款的規定，該科的職責包括制定家禽與水生動物防疫政策、法規、方案、計畫，研究相關科技，策劃疫病疫情管制業務等。這些職責主要是保障家禽和水生動物的健康，並控制疫情的擴散。 為了與參考資料建立連結，可以參考動植物防疫檢疫局相關的案例或研究報告，例如該機構在應對家禽或水生動物疫情時的具體措施，或是其對家禽和水生動物相關科技的研究成果。再者，可以針對農業相關期刊或政府部門公佈的統計資料來支持相關的資訊。
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