自由港區事業未依第九條及第十六條規定提報營運績效資料者，經自由港區管理機關稽核，並就應改正事項通知限期改正而未改正，自由港區管理機關得依自由貿易港區事業營運管理辦法第十六條規定處理。
對於營利事業於自由貿易港區從事貨物採購輸入儲存或運送免徵營利事業所得稅辦法第18條的情況，根據自由貿易港區事業營運管理辦法第九條及第十六條的規定，如果自由港區事業未按規定提報營運績效資料，經管理機關稽核後，並通知限期改正而未改正，管理機關得依營運管理辦法第十六條規定處理。這意味著自由港區事業應按時提交營運績效資料，如果未能遵守規定並未在限期內改正，將面臨管理機關的處理。 與此相關的資料來自於《自由貿易港區事業營運管理辦法》第九條、第十六條的規定，並無具體案例可提供。
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