資料來源：司法院法令判解系統
一、依據畜牧法施行細則第四條規定「申請牧場登記應檢具環境保護機關審查核准之污染防治措施計畫書。其於本法施行前已設立者，應檢具排放許可證」；暨行政院農業委員會八十八年五月七日八八農牧字第八八○四一○六號函公告事項略以：「已達畜牧法第四條第一項規定飼養規模而未領有牧場登記證書者，應自八十八年七月一日起，至八十九年六月三十日止，提出申辦牧場登記．．．」
內文
全文內容：一、依據畜牧法施行細則第四條規定「申請牧場登記應檢具環境保護機關審查核准之污染防治措施計畫書。其於本法施行前已設立者，應檢具排放許可證」；暨行政院農業委員會八十八年五月七日八八農牧字第八八○四一○六號函公告事項略以：「已達畜牧法第四條第一項規定飼養規模而未領有牧場登記證書者，應自八十八年七月一日起，至八十九年六月三十日止，提出申辦牧場登記…」。
二、牧場登記既為目的事業主管機關核發之相關許可登記，爰此，為利於環境保護主管機關審查、核發畜牧業廢（污）水排放許可證或暫時排放許可文件，爰依相關規定，訂定「畜牧業申請廢（污）水排放許可審查原則」，請據以參考辦理。
三、事業係屬新設或既設應由業者或農政主管機關提供相關佐證資料，俾憑辦理。
備註：
畜牧業申請廢（污）水排放許可審查原則
一、新設事業
（一）屬水污染防治法第十三條規定，應先檢具水污染防治措施計畫者－八十八年七月一日後新設立之畜牧業，屬水污染防治法第十三條規定，應先檢具水污染防治措施計畫者，經環保主管機關審查核准後，檢具上開核准之文件，向農政主管機關申請牧場登記。並於取得該牧場登記證後，檢具牧場登記證及相關之文件，向環保主管機關申請排放許可證。
（二）非屬水污染防治法第十三條規定，無須檢具水污染防治措施計畫者－八十八年七月一日後新設立之畜牧業，非屬水污染防治法第十三條規定，無須檢具水污染防治措施計畫審核文件者，直接依農政主管機關規定申請牧場登記。並於取得牧場登記後，檢具牧場登記證及相關文件，向環保主管機關申請排放許可證或暫時排放許可文件。
二、既設事業
（一）新申請排放許可證或暫時排放許可文件者（例如尚未取得或舊證失效者）－應逕向農政主管機關申請牧場登記，並於取得該牧場登記證後，檢具牧場登記證及相關之文件，向環保主管機關申請排放許可證或暫時排放許可文件。惟地方主管機關應確實嚴密查核該等業者，是否未經許可排放廢（污）水，並依水污染防治法規定辦理。
（二）申請廢（污）水排放許可展延者－八十八年七月一日後領有廢（污）水排放許可證或暫時排放許可文件之畜牧業，申請展延時，應檢具牧場登記證及相關之文件，向環保主管機關申請展延。未能檢具牧場登記證者，主管機關應依水污染防治法施行細則第二十七條之規定，通知限期補正（補正期間不得過九十日），逾期不補正者，主管機關應予駁回，並通知不得排放廢（污）水。
