ข้อ ๓ มหาวิทยาลัยบูรพา มีส่วนงานและภาระหน้าที่ของส่วนงาน ดังต่อไปนี้
๓.๑ สำนักงานสภามหาวิทยาลัย เป็นหน่วยงานบริหารและธุรการของสภามหาวิทยาลัย มีนายกสภามหาวิทยาลัยเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒ สำนักงานอธิการบดี เป็นหน่วยงานกลางในการบริหารงานของมหาวิทยาลัย มีอธิการบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด และมีรองอธิการบดีฝ่ายต่าง ๆ และผู้ช่วยอธิการบดีช่วยปฏิบัติภารกิจของอธิการบดี
๓.๓ คณะการจัดการและการท่องเที่ยว (บ้านบึง) จัดการศึกษาระดับปริญญาตรี วิจัยและบริการวิชาการด้านบริหารธุรกิจ บัญชี การจัดการและการท่องเที่ยว และจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาด้านบัญชี การจัดการและการท่องเที่ยว มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๔ คณะการแพทย์แผนไทยอภัยภูเบศร จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านการแพทย์แผนไทยและเภสัชศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๕ คณะเทคโนโลยีการเกษตร (สระแก้ว) จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านเกษตร มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๖ คณะเทคโนโลยีทางทะเล (จันทบุรี) จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีทางทะเล มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๗ คณะพยาบาลศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านพยาบาลศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๘ คณะแพทยศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านแพทยศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๙ คณะมนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านมนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๐ คณะรัฐศาสตร์และนิติศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรี วิจัยและบริการวิชาการด้านรัฐศาสตร์ รัฐประศาสนศาสตร์และนิติศาสตร์ และจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาด้านรัฐศาสตร์และนิติศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๑ คณะโลจิสติกส์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านโลจิสติกส์และการขนส่งทุกรูปแบบ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๒ คณะวิทยาศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านวิทยาศาสตร์และวิทยาศาสตร์ประยุกต์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๓ คณะวิทยาศาสตร์การกีฬา จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านวิทยาศาสตร์การกีฬา มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๔ คณะวิศวกรรมศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านวิศวกรรมศาสตร์และเทคโนโลยี มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๕ คณะศิลปกรรมศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านศิลปกรรม ดนตรี และการแสดง ตลอดจนทะนุบำรุงศิลปะและวัฒนธรรม มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๖ คณะศิลปศาสตร์ (จันทบุรี) จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านวิทยาศาสตร์ วิทยาศาสตร์ประยุกต์ ศิลปศาสตร์และสังคมศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๗ คณะศึกษาศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านศึกษาศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๘ คณะสังคมศาสตร์ (สระแก้ว) จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านวิทยาศาสตร์ วิทยาศาสตร์ประยุกต์ มนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๑๙ คณะสาธารณสุขศาสตร์ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านสาธารณสุขศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๐ คณะอัญมณี (จันทบุรี) จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีและบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการวิชาการด้านอัญมณีและเครื่องประดับ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๑ วิทยาลัยการบริหารรัฐกิจ จัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านรัฐประศาสนศาสตร์ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๒ วิทยาลัยนานาชาติ จัดการศึกษาระดับปริญญาตรีทุกสาขาวิชาเป็นภาษาต่างประเทศ มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๓ วิทยาลัยพาณิชยศาสตร์ จัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา วิจัยและบริการวิชาการด้านบริหารธุรกิจ โดยอาจจัดการศึกษาระดับปริญญาตรีหรือประกาศนียบัตรได้แต่การจัดการศึกษาระดับปริญญาตรีให้กระทำได้เมื่อได้รับอนุมัติจากสภามหาวิทยาลัย มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๔ วิทยาลัยวิทยาการวิจัยและวิทยาการปัญญา จัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาวิจัยและบริการด้านวิทยาการวิจัยและวิทยาการปัญญา มีคณบดีเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๕ สถาบันวิจัยวัฒนธรรมและศิลปะ เป็นหน่วยงานกลางในการประสานงานและดำเนินการด้านการวิจัยทางวัฒนธรรมและศิลปะ ให้บริการวิชาการ เผยแพร่ความรู้ และทะนุบำรุงวัฒนธรรมและศิลปะ มีผู้อำนวยการสถาบันเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๖ สถาบันวิทยาศาสตร์ทางทะเล วิจัยและบริการวิชาการด้านวิทยาศาสตร์ทางทะเล สนับสนุนงานด้านการเรียนการสอนและการวิจัย มีผู้อำนวยการสถาบันเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๗ สำนักคอมพิวเตอร์ เป็นหน่วยงานกลางในการประสานงาน กำหนดแผนงานที่มีการใช้เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสารของมหาวิทยาลัย วิเคราะห์และพัฒนาระบบสารสนเทศเพื่อการดำเนินงานและการบริหารกิจการของมหาวิทยาลัย ให้บริการระบบคอมพิวเตอร์ เครือข่ายและโทรคมนาคม เพื่อสนับสนุนงานด้านการเรียนการสอนและการวิจัย ถ่ายทอดเผยแพร่ความรู้ด้านเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสารให้แก่บุคลากรและนิสิตของมหาวิทยาลัย และให้บริการวิชาการแก่ชุมชน มีผู้อำนวยการสำนักเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๘ สำนักบริการวิชาการ เป็นหน่วยงานกลางในการประสานงานและดำเนินการด้านการบริการวิชาการแก่สังคมของมหาวิทยาลัย มีผู้อำนวยการสำนักเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด
๓.๒๙ สำนักหอสมุด เป็นหน่วยงานกลางในการบริหารงานห้องสมุดและสารสนเทศที่สนับสนุนภารกิจของมหาวิทยาลัยในการพัฒนาการเรียนการสอน การค้นคว้าวิจัยและการบริการวิชาการแก่สังคม มีผู้อำนวยการสำนักเป็นผู้บังคับบัญชาสูงสุด