ข้อ ๓ ให้ยกเลิกความในข้อ ๑๖ แห่งระเบียบกระทรวงกลาโหมว่าด้วยการคุ้มครองพยานในคดีอาญา
พ.ศ. ๒๕๔๘ ซึ่งแก้ไขเพิ่มเติมโดยระเบียบกระทรวงกลาโหมว่าด้วยการคุ้มครองพยานในคดีอาญา
(ฉบับที่ ๒) พ.ศ. ๒๕๕๔ และให้ใช้ความต่อไปนี้แทน
ข้อ ๑๖
ให้มีคณะกรรมการคุ้มครองพยานกระทรวงกลาโหม
ประกอบด้วย เจ้ากรมพระธรรมนูญหรือผู้แทนเป็นประธานกรรมการ ผู้แทนสำนักตุลาการทหาร กรมพระธรรมนูญ
ผู้แทนสำนักงานอัยการทหาร กรมพระธรรมนูญ ผู้แทนกองสงเคราะห์ทางกฎหมาย กรมพระธรรมนูญ
ผู้แทนสำนักนโยบายและแผนกลาโหม ผู้แทนกรมเสมียนตรา ผู้แทนสำนักงบประมาณกลาโหม ผู้แทนกองบัญชาการกองทัพไทย ผู้แทนกองทัพบก ผู้แทนกองทัพเรือ
ผู้แทนกองทัพอากาศ หน่วยละหนึ่งคนเป็นกรรมการ และผู้อำนวยการกองคุ้มครองพยาน
กรมพระธรรมนูญ เป็นกรรมการและเลขานุการ ให้ประธานกรรมการแต่งตั้งข้าราชการกรมพระธรรมนูญเป็นผู้ช่วยเลขานุการจำนวนตามความเหมาะสม
ให้มีเขตอำนาจไม่จำกัดพื้นที่
ให้มีคณะกรรมการคุ้มครองพยานมณฑลทหาร
ประกอบด้วยเจ้าหน้าที่ซึ่งปฏิบัติราชการประจำในเขตพื้นที่มณฑลทหาร มีจำนวนตามความเหมาะสม
ในแต่ละคณะกรรมการให้มีเลขานุการคณะละหนึ่งคน มีเขตอำนาจเหนือพื้นที่ซึ่งกำหนดโดยกฎกระทรวงออกตามความในกฎหมายว่าด้วยการจัดระเบียบราชการกระทรวงกลาโหม
ทุกมณฑลทหารให้มีสำนักงานคุ้มครองพยานมณฑลทหารหนึ่งแห่ง
เว้นแต่มณฑลทหารที่เป็นที่ตั้งกรมพระธรรมนูญ
ให้กองคุ้มครองพยาน
กรมพระธรรมนูญ เป็นสำนักงานในส่วนกลาง