軍旗不使用時，應捲好放置或裝箱，或豎立於通風乾燥之適當地點，有旗套者裝入旗套內，妥為保管。尤對於潮濕之軍旗，應先曬乾；清潔時應以適於軍旗色質之方法洗滌。
陸海空軍軍旗條例施行細則 第五章 保管與管理
§ 58–62共 5 條
軍旗陳舊或損壞時，應呈繳原製頒單位申請換發或核准後自行製換使用，並將陳舊或損壞之軍旗予以焚燬，不得改製其他用品，或作不敬之處理。
各單位主官移交時，應將各種軍旗列冊移交。
編併裁撤單位，應將所領胂旗，呈繳原製頒單位保管，或經核准後自行焚燬。
軍旗式樣除另有規定外，不得擅自綴置各種標誌符號。
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