根據行政法人法第19條，行政法人在會計年度結束後的一定時間內，應將年度執行成果及決算報告書交由委託的會計師進行查核簽證，並提交給董事會審議後，經由監事或監事會通過後報請監督機關備查，同時也需送交審計機關審核。 根據行政法人法第19條第2項，審計機關有權對前述的決算報告進行審計，並將審計結果送交監督機關或其他相關機關進行必要的處理。 這些規定的目的是為了確保行政法人的財務狀況得到妥善監督和審核。行政法人在進行財務報告和決算時需遵循相應的程序和規定，並接受外部專業機構（會計師和審計機關）的查核和審計，以確保財務資訊的可靠性和透明度，並對監督機關提供相關的報告和資料，以便進一步的審核和監督。 一個相關的例子是根據行政院主計處90年4月30日台90處實二字第02753號函說明，該函提到行政機關可以向審計機關諮詢或函請審計機關進行查核，當他們對特定預算項目有疑義或發現不實情況時。這個例子反映了行政法人在會計和監督方面的責任和程序。
行政法人於會計年度終了一定時間內，應將年度執行成果及決算報告書，委託會計師查核簽證，提經董（理）事會審議，並經監事或監事會通過後，報請監督機關備查，並送審計機關。 前項決算報告，審計機關得審計之；審計結果，得送監督機關或其他相關機關為必要之處理。
立法理由一、第一項明定行政法人年度執行成果及決算報告書，報請監督機關備查並送審計機關之程序及期限。至於提報期限，得審酌各該行政法人業務特性，於行政法人個別組織法律或通用性法律明定之，以符彈性。 二、顧及審計機關對行政法人之審計監督權，並兼顧行政法人之自主性，爰明定第二項。
一、第一項明定行政法人年度執行成果及決算報告書，報請監督機關備查並送審計機關之程序及期限。至於提報期限，得審酌各該行政法人業務特性，於行政法人個別組織法律或通用性法律明定之，以符彈性。 二、顧及審計機關對行政法人之審計監督權，並兼顧行政法人之自主性，爰明定第二項。
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