遇難或避難船舶進港泊靠後，應即補辦下列手續： 一、補填入港報告單，連同旅客名單、船員名冊及災難情形報告書，先送當地航政機關查核簽證後，分送海岸巡防署所屬單位、港務警察單位、檢疫機關、中央工業主管機關及公民營事業。 二、遇難船舶應將海事報告書送交當地航政機關依海事報告規則處理，並應接受海事調查。 三、船長應赴當地航政機關報到，並依有關法令規定，將船舶應備文書送請當地航政機關查驗。 前項船舶進港後，除船用補給品外，如有上下客貨，或逾二十四小時開航出口者，應另行向海關辦理進口申報及出口結關手續。
根據工業專用港及工業專用碼頭經營管理辦法第 49 條，當遇難或避難船舶進港泊靠後，需要補辦以下手續： 1. 補填入港報告單，並連同旅客名單、船員名冊及災難情形報告書，先送當地航政機關查核簽證後，再分送海岸巡防署所屬單位、港務警察單位、檢疫機關、中央工業主管機關及公民營事業等單位。 2. 遇難船舶應將海事報告書送交當地航政機關，依照海事報告規則進行處理，並且應接受海事調查。 3. 船長則應前往當地航政機關報到，並按照相關法令規定，將船舶應備文件送請當地航政機關查驗。 此外，根據該條規定，船舶進港後如果有上下客貨或者須逾二十四小時開航出口，則需另行向海關辦理進口申報及出口結關手續。 參考資料： - 工業專用港及工業專用碼頭經營管理辦法（最新修正日期：2018年10月2日）
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