本中心之採購作業，應本公開、公正之原則，除符合我國締結之條約、協定或政府採購法第四條所定情形，應依各該規定辦理外，不適用政府採購法之規定；其採購作業實施規章，應報請監督機關核定。 前項應依政府採購法第四條規定辦理之採購，於其他法律另有規定者，從其規定。
根據國家資通安全科技中心設置條例第30條，該中心的採購作業應遵循公開、公正的原則，除了符合國際條約、協定或政府採購法第四條規定的情形外，不適用政府採購法的規定。而該中心的採購作業實施規章，則需要經過監督機關的核定。 同時，根據前項規定，應依照政府採購法第四條的規定辦理的採購，如果其他法律有相關規定，則適用該法律的規定。
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