公民營事業填造工業專用港區域土地所投入之費用，得按實際投資成本折抵其應繳付之土地租金；折抵方式另行協議。 前項實際投資成本，應由公民營事業編製施工預算，報請中央工業主管機關核准後施工；施工完成後，應依實際支出之開發成本作成結算，由會計師查核簽證後，報請中央工業主管機關核定。
根據工業專用港及工業專用碼頭經營管理辦法第 7 條，當公民營事業填造工業專用港區域土地所投入的費用時，可以按照實際投資成本折抵應繳的土地租金。而折抵的方式需要進行另外的協議。對於前項的實際投資成本，公民營事業應該先編製施工預算，然後報請中央工業主管機關核准後進行施工。施工完成後，應根據實際支出的開發成本進行結算，並由會計師進行查核簽證後，再報請中央工業主管機關核定。 這條法規的參考資料可以參考《工業區土地使用規則》（中華民國內政部主管 2021年最新修訂版）。在該規則中，有提到公民營事業填造工業專用港區域土地的相關規定。例如，根據該規則第 5 條第 3 項，工業區土地的使用產權發票價超過五億元者，可根據投資成本折舊法折舊報銷。此外，參考資料還可以包括中央工業主管機關（例如經濟部）所發布的相關公告或指引文件。
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