所得稅法 第 98-1 條（國際運輸事業營利所得稅之繳納）

依所得稅法第 114 條，扣繳義務人未依規定扣繳稅款者，除補繳稅款外另處罰鍰。主動補報補繳通常可以減輕處罰。如果境外企業已經自行繳納，取得其繳稅證明可作為免罰或減罰依據。內行人提示：每年結算申報前自行盤點過去十二個月的跨境付款紀錄，比等國稅局來查再補便宜得多。

規範境外營利事業適用第 25 條核定所得時的三層繳稅程序：分公司自繳、代理人扣繳、給付人扣繳，是台灣對國際運輸業等非居民企業的稅務程序總開關。

第 25 條解決「外國公司在台所得怎麼算」（按營業收入比例核定），第 98 條之 1 解決「算出來的稅怎麼繳」（依在台存在程度三層分流），兩條是配套組合拳。

依所得稅法定義為總機構在中華民國境外的營利事業，包含外國公司本身、或其分公司之母公司。重點在「總機構」位置不在台灣，不是看股東國籍。

代理境外營利事業在台從事業務行為（接單、報價、收款、簽約）的人，依本條第二款為法定扣繳義務人。實務上常是台灣的代理商或法務代表。

在給付時直接從匯款金額扣下稅款 → 依第 92 條於次月 10 日前繳庫並申報 → 開立扣繳憑單給對方 → 留存核准文件與繳款書收據備查。

給付總額 × 第 25 條核定所得比例（國際運輸業為 10%）× 扣繳率（依各類所得扣繳率標準，通常 20%）。實際稅負約為給付金額的 2%，但租稅協定可能降低。

立即主動補報補繳，可減輕處罰。檢視過去十二個月所有跨境付款紀錄，一次盤點處理。如境外企業已自行繳納，取得其繳稅證明可作為免罰依據。

查對方在台是否有分公司（經濟部登記）→ 有：第一款；無分公司但有營業代理人合約 → 第二款；都沒有 → 第三款由你扣繳。判斷錯選錯款 = 義務沒消失只是換人扛。

第 88 條是所有非居住者各類所得扣繳的一般規定；第 98 條之 1 是針對「適用第 25 條核定所得的境外營利事業」的特別程序，加入三層責任分流設計。一般通用 vs 特別程序。