根據國立大學校院校務基金設置條例第8條，國立大學校院的稽核人員或稽核單位應負責以下任務： 1. 對於涉及校務基金交易循環的人事、財務、營運和關係人交易事項進行事後查核。 2. 對現金出納和壞帳處理進行事後查核。 3. 對現金、銀行存款、有價證券、股票、債券和固定資產等進行稽核和盤點。 4. 定期評估、稽催和彙整報告校務基金各項業務的績效目標達成度。 5. 對校務基金的運用效率和各項支出的效益進行查核和評估。 6. 其他專案稽核事項。 根據該條第二款的規定，交易循環包括收入循環、採購與支付循環、薪資循環、財產管理循環、投資循環、融資循環和研發循環等。 根據該條第三款的規定，國立大學校院應根據風險評估結果制定年度稽核計畫，並向校務會議提交年度稽核報告。 以上資料來自《國立大學校院校務基金設置條例》，最新修正日期為2020年12月10日。
各校校務基金預算之編製，應審酌基金之財務及預估收支情形，並以維持基金收支平衡或有賸餘為原則。
立法理由明定各校校務基金年度收支預算之編製，應以維持平衡或有賸餘為原則。
國立大學校院稽核人員或稽核單位之任務如下： 一、人事、財務、營運及關係人交易事項，涉及校務基金交易循環之事後查核。 二、現金出納及壞帳處理之事後查核。 三、現金、銀行存款、有價證券、股票、債券與固定資產等之稽核及盤點。 四、校務基金各項業務績效目標達成度之定期評估、稽催及彙整報告。 五、校務基金運用效率與各項支出效益之查核及評估。 六、其他專案稽核事項。 前項第一款所定交易循環，包括收入循環、採購與支付循環、薪資循環、財產管理循環、投資循環、融資循環及研發循環等。 國立大學校院應依風險評估結果，擬訂年度稽核計畫，並作成年度稽核報告，向校務會議報告。
立法理由一、本條新增。 二、第一項分款定明國立大學校院稽核人員或稽核單位之任務。 三、第二項定明第一項第一款所定交易循環之範疇。 四、國立大學校院稽核人員負責校務基金各項內部控制稽核，並依年度稽核計畫執行，爰於第三項定明應擬定稽核計畫，並作成年度稽核報告。
明定各校校務基金年度收支預算之編製，應以維持平衡或有賸餘為原則。
一、本條新增。 二、第一項分款定明國立大學校院稽核人員或稽核單位之任務。 三、第二項定明第一項第一款所定交易循環之範疇。 四、國立大學校院稽核人員負責校務基金各項內部控制稽核，並依年度稽核計畫執行，爰於第三項定明應擬定稽核計畫，並作成年度稽核報告。
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