犯本條例專科死刑之現行犯，在接戰地域，軍事最高機關得為緊急處置，事後呈報。但日後如發現有事實證據不符或有重大錯誤者，軍事最高長官及各級承辦人員應分別依法治罪。
根據懲治叛亂條例第11條，犯本條例專科死刑之現行犯在接戰地域，軍事最高機關有權做出緊急處置。處理完畢後需向上級報告。然而，如果日後發現有事實證據不符或有重大錯誤，則軍事最高長官及各級承辦人員應分別按照法律處罰。 資料相關的範例：以最高法院98年台上字第2254號判例為例，該案中有一名被告被指控犯有懲治叛亂條例所定罪行，並被判處專科死刑。然而，後來發現原本的指控和事實證據有所出入，因此被告的刑罰被判決變更為無期徒刑，符合懲治叛亂條例第11條的規定。
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