生物醫療廢棄物之廢尖銳器具及感染性廢棄物之清除方法，除中央主管機關另有規定外，應符合第十三條至第十六條及下列規定： 一、以不同顏色容器貯存之廢棄物不得混合清除。 二、於運輸過程，不可壓縮及任意開啟。 三、運輸途中應備有冷藏措施，並維持正常運轉。但離島地區因交通不便者，經廢棄物產生事業所在地之地方主管機關同意後，得於部分運輸路程中，不須備有冷藏措施。 四、於裝卸過程若無工作人員在場，應保持清除車輛倉門關閉並上鎖。
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