又稱自行迴避，法官具有法定原因，即應自行迴避參與審判。因刑事訴訟法第17條所規範法定迴避之原因，在客觀事實足認有偏頗之處，難以期待法官以中立第三人之角色公平審判。例如A法官之子因案被訴，為維護審判公平，A依法應迴避該案件之審理。

實質上一罪或裁判上一罪之案件，於訴訟法上係以不可分的一個客體予以處理，即所謂不可分原則，又稱為案件之單一性。案件單一性在法律上的效果包括：(一)公訴提起的效力及於單一性案件的全部，此即公訴不可分原則。例如，甲未經乙的同意，進入乙的住家恐嚇乙「如果不還錢，將殺死乙」，檢察官僅就恐嚇部分起訴，而漏未就已經乙合法告訴的無故侵入住宅部分予以起訴，但起訴的效力仍及於具有想像競合關係的侵入住宅罪，法院仍應一併審理；(二)判決的效力也在案件單一的範圍內及於全部(審判不可分)。如上開案例，如果法院仍僅就恐嚇的部分判處罪刑確定，檢察官事後發現漏未將侵入住宅部分起訴，而再行就此部分起訴，因為恐嚇判決的效力及於侵入住宅部分，檢察官依法不能再就侵入住宅起訴，法院必須就再行起訴的侵入住宅部分諭知免訴判決；(三)對於判決的一部上訴者，其有關係的部分，視為亦已上訴(上訴不可分)。

指規範於行政法中具刑事法律效果之規定，屬廣義刑法，如公司法第9條第1項。除有特別規定，仍適用刑法總則相關法條，如刑法第12條，於行政刑法適用之，此類案件同樣依刑事訴訟程序予以追訴、審判及執行。

解釋一：檢察官、檢察事務官、司法警察官或司法警察逮捕被告、犯罪嫌疑人或執行拘提、羈押時，雖無搜索票而得逕行搜索之。對象以被告或犯罪嫌疑人之身體、隨身攜帶之物件、所使用之交通工具及其立即可觸及之處所為限。例如：受搜索人於飯店用餐時，搜索權人亦得搜索其立即可觸及之處，即其座位附近之處。 解釋二：在執行拘提、逮捕被告（或犯罪嫌疑人）後，為了保護執法者及被告自身安全或防止湮滅證據，而時間上急迫來不及聲請搜索票，刑事訴訟法第130條規定可以在沒有搜索票的情形下進行附帶搜索。 附帶搜索可以搜索的範圍，包括身體、隨身攜帶的物件、使用的交通工具及可立即觸及到的處所。例如，警員在逮捕涉嫌毒品犯罪的被告時，對於被告當時使用的交通工具自用小客車可立即觸及之處所，進行附帶搜索，結果在搜索過程中發現槍枝、子彈。

解釋一：告訴乃論之罪一經合法提起告訴，對於其他共犯而言，對其中一人告訴之效力及於其他共犯而言。亦即，告訴人告共犯的其中一人就等於告全部共犯，決定不告共犯中的其中任何一人就等於不告所有共犯。例如甲乙二人共同圍毆丙，事後丙憤而向檢察官對甲提起傷害告訴，則該告訴效力同時及於乙。 解釋二：依照刑事訴訟法第239條規定，告訴乃論之罪，對於共犯中的一人提出告訴或者撤回告訴的話，不論是提出告訴的效力，或者是撤回告訴的效力，都會擴及到其他共犯。不過，在通姦的情形，刑事訴訟法第239條但書有例外的規定，假如告訴人原諒配偶的通姦行為，對配偶撤回告訴的話，撤回的效力不會及於跟配偶通姦的人（即相姦人，俗稱小三、小王）。也就是說，檢察官仍要對相姦人依法偵查及提起公訴。 例如，甲、乙共同打傷丙後，因為甲下手比較重，丙只對甲提出傷害告訴，但提出告訴的效力也會擴及到乙。因此，檢察官對於乙的傷害行為，必須要偵查，認為有犯罪事證時，可以同時起訴甲和乙。如果後來丙與乙達成和解，只對乙撤回告訴，但是撤回傷害告訴的效力也會及於甲。所以，檢察官對於甲、乙共同打傷丙的犯行，都要作不起訴處分。

解釋一：一般的搜索程序原則上要先由法官核發搜索票。但是刑事訴訟法第131條有規定，於：一、因逮捕被告、犯罪嫌疑人或在執行拘提、羈押的時候，有事實足夠認定被告或犯罪嫌疑人確實在某個地點裡面。二、因追捕現行犯或逮捕脫逃的人，有事實足夠認定現行犯或脫逃人確實在某個地點裡面。三、有明顯事實足以相信為有人某個地點裡面犯罪而且情形急迫。在以上這些情形，檢察官、檢察事務官、司法警察官或司法警察，雖然沒有取得法官核發的搜索票，也可以直接搜索住宅或其他場所。另外，檢察官在偵查的時候，有相當理由認為情況急迫，若不迅速搜索，在24小時內將有證據有偽造、變造、湮滅或隱匿的可能，檢察官也可以不用搜索票直接去搜索，或指揮檢察事務官、司法警察官或司法警察執行搜索，並同時報告檢察長。以上這些搜索，都稱之為緊急搜索。這樣的搜索如果是由檢察官來做的話，應於搜索之後3日內陳報法院；如果是由檢察事務官、司法警察官或司法警察來做的話，也要在3日內報告檢察官及法院。法院收到報告後，如果認為不應准許的話，應在5天以內撤銷這些搜索。 解釋二： 緊急搜索可以區分為對「人」的緊急搜索及對「物」的緊急搜索二種，不論是對「人」或是對「物」的緊急搜索，在搜索完畢必須事後陳報法院，否則會被法院認為是違法取得的證據，進而得認定無證據能力。對「人」的緊急搜索：為避免被告或犯罪嫌疑人脫逃，或有事實認為有人在內犯罪，為阻止犯罪發生，但因情況急迫，來不及聲請搜索票，刑事訴訟法第131條第1項規定，例外可以在無搜索票下進行搜索。這種搜索的目的，在於發現被告、犯罪嫌疑人或應被拘捕的人，是「人」的發現，必須限於對住宅或其他處所搜索，一旦搜索到應被逮捕或拘提的人後，即應停止搜索。例如，員警聽到屋內有人喊救命，因為情況急迫，緊急進入屋內搜索犯罪者及阻止犯罪繼續進行。 對「物」的緊急搜索：檢察官在偵查中有相當理由認為情況急迫，若不立即搜索，證據可能在24小時內會被偽造、變造、湮滅或隱匿時，為保全證據，刑事訴訟法第131條第2項規定可以在無搜索票情形下搜索。例如，檢察官依據監聽內容，知道甲涉嫌參與製造第二級毒品，部分已接近製造完成，疑似進一步聯絡交付毒品給第三人，如果將製造的毒品交付第三人，證據將會被湮滅或隱匿，且有急迫性，有保全證據的必要。因此，檢察官可以不用聲請搜索票，而直接發動搜索，以搜得第二級毒品安非他命、半成品及相關設備與原料。

刑法規定，第三人因特定原因而取得被告犯罪所得時，該不法利得應予沒收。法院審理被告犯罪及沒收犯罪所得的訴訟程序，財產可能被沒收的第三人可以聲請參與，或經由法院命令參與，對於沒收第三人財產陳述意見及提出答辯。

又稱起訴合理主義、起訴裁量主義，是與「起訴法定主義」相對的概念，指檢察官對於有足夠的犯罪嫌疑並具備起訴條件的案件，可以斟酌決定是否起訴的原則。檢察官雖認定犯罪嫌疑重大達到起訴門檻的案件，仍然可以依據法律的授權，考量刑事懲戒的目的及權衡各種利益，決定起訴被告是否適當，來選擇起訴被告或給予緩起訴、不起訴處分。有些國家，如日本，是採取「起訴便宜主義」，檢察官即使查明犯罪事實，也有決定起訴與否的權限；在我國，原則則採「起訴法定主義」，但例外也兼有「起訴便宜」的規定者，例如：刑訴第253條規定，第376條所規定之案件，檢察官參酌刑法第57條所列事項,認為以不起訴為適當者，得為不起訴之處分。

失權期間係指遲誤法律所規定應為一定訴訟行為之期間，即喪失為該訴訟行為之權利，如刑事訴訟上訴期間為十日、抗告期間為五日、聲請再議期間為七日。例如遲誤上訴期間十日者，即喪失上訴之權利，原判決將因此確定。

當事人非因過失，遲誤了刑事訴訟程序的法定期間，得於其原因消滅後五日內，聲請回復原狀。如果當事人是因為遲誤上訴、抗告或聲請再審的期間而聲請回復原狀時，應由受聲請的法院，也就是原審法院決定是否應該許可，原審法院認為應該許可回復原狀聲請時，即應「繕具」意見書，也就是書寫及出具意見書，並將該上訴或抗告案件送由上級法院合併裁判（刑事訴訟法第68條、第69條規定參看）。