依加值型及非加值型營業稅法（下稱營業稅法）第5條及第6條之1規定，保稅區是指政府核定的加工出口區、科學工業園區、農業科技園區或自由貿易港區，以及海關管理的保稅工廠、保稅倉庫、物流中心或其他經目的事業主管機關核准設立且由海關監管的專區。保稅區營業人把保稅貨物自國外進入上述專區，都不會視為進口，而不用課徵營業稅。但若保稅區營業人將保稅貨物自保稅區進入中華民國境內的其他應稅地區，應屬進口貨物，除符合營業稅法第9條規定免徵營業稅外，須由海關代徵應徵收的營業稅。

違反稅法的處罰，有因行為人違反稅法上之作為或不作為義務而予處罰者，不以漏稅為必要，為行為罰（至於因逃漏稅捐而予處罰者，則為漏稅罰）。此所稱行為義務，例如稅籍登記、辦理結算申報等。舉例而言，如加值型及非加值型營業稅法第47條規定：「納稅義務人，有下列情形之一者，除通知限期改正或補辦外，並得處新臺幣三千元以上三萬元以下罰鍰；屆期仍未改正或補辦者，得按次處罰，並得停止其營業：一、核定應使用統一發票而不使用。二、將統一發票轉供他人使用。三、拒絕接受營業稅繳款書」。

在行政罰領域，數行為違反數個行政處罰的法規範，可併合處罰。例如，進口人填具進口報單時，需分別填載進口稅、貨物稅及營業稅相關事項，向海關遞交，始完成進口稅、貨物稅及營業稅的申報，故實質上為3個申報行為，而非一行為。如未據實申報，致逃漏進口稅、貨物稅及營業稅，分別符合海關緝私條例第37條第1項第4款、貨物稅條例第32條第10款暨加值型及非加值型營業稅法第51條第7款規定者，應併合處罰，不生一行為不二罰的問題（司法院釋字第754號解釋文參照）。

依加值型及非加值型營業稅法第1條規定，在中華民國境內銷售貨物或勞務及進口貨物，均應依該法規定課徵加值型或非加值型營業稅。營業稅性質上屬於「消費稅」，是由消費者負擔，只是若由政府直接向消費者課徵營業稅，因交易數量十分龐大，有徵收上的困難，基於稽徵經濟的考量，因此在立法技術上以營業人為納稅義務人，但實際上則是利用銷項稅額扣抵進項稅額的方法，經由後續交易轉嫁由最終買受貨物或勞務的消費者負擔。營業稅，依銷售商品或勞務性質的不同，區分為「應稅」、「零稅率」或「免稅」。「應稅」者，依該法第10條規定，除另有規定外，稅率最低不得少於5%，最高不得超過10%，其徵收率由行政院定之。現行稅率為5%。

因納稅義務人逃漏稅捐而予違反稅法之處罰者，為漏稅罰。例如：依加值型及非加值型營業稅法第51條第1項第3款規定，短報或漏報銷售額，按所漏稅額處5倍以下罰鍰之漏稅罰。

進項稅額是指納稅義務人為了營業目的而購買應稅貨物或勞務所支付的營業稅稅額，換句話說，是指購買時已經繳交的營業稅，就是進項稅額。因為於購買商品或服務時已付過營業稅給出賣人，所以在其之後銷貨申報營業稅時可以扣除，以免重覆繳納營業稅。但須特別注意的是，若屬加值型及非加值型營業稅法第19條第1項規定：「營業人左列進項稅額，不得扣抵銷項稅額：一、購進之貨物或勞務未依規定取得並保存第33條所列之憑證者。二、非供本業及附屬業務使用之貨物或勞務。但為協助國防建設、慰勞軍隊及對政府捐獻者，不在此限。三、交際應酬用之貨物或勞務。四、酬勞員工個人之貨物或勞務。五、自用乘人小汽車。」的進項稅額，就不可以扣除。

依加值型及非加值型營業稅法第7條規定，外銷貨物、與外銷有關的勞務，或在國內提供而在國外使用的勞務，其營業稅稅率為零。依同法第35條規定，營業人銷售貨物或勞務，依第7條規定適用零稅率者，得申請以每月為一期，於次月15日前依前項規定向主管稽徵機關申報銷售額、應納或溢付營業稅額。但同一年度內不得變更。