- 國防部因軍事審判業務及處理軍人權益行政爭議事件需要，特設軍事法院。戰時得授權軍事法院，於戰區設臨時法庭。
- 本準則所稱軍事法院分為下列三級： 一、地方軍事法院及其分院。 二、高等軍事法院及其分院。 三、最高軍事法院。
國防部各級軍事法院組織準則 第一章 軍事法院
§ 1–11共 12 條
各級軍事法院之職掌事項及管轄，依軍事審判法及軍人權益事件處理法規定。
- 最高軍事法院置院長一人，由軍事審判官兼任，少將。
- 高等軍事法院及其分院各置院長一人，由軍事審判官兼任，均上校。
- 地方軍事法院及其分院各置院長一人，由軍事審判官兼任，均上校。
- 各級軍事法院及其分院設審判庭，其庭數視事務繁簡定之。
- 地方軍事法院設官兵權益保障會，分組辦事，相關事務由所屬審判庭辦理。
- 高等軍事法院及其分院設勤務法庭，相關事務由所屬審判庭辦理。
- 第一項各庭置庭長一人，由軍事審判官兼任，監督各該庭事務。
- 各級軍事法院及其分院置公設辯護人若干人，掌理指定辯護案件之辯護。
- 有二以上公設辯護人時，以一人為主任公設辯護人，監督及分配公設辯護事務。
- 地方軍事法院置國防法務官若干人，專任官兵權益保障會委員，掌理軍人復審及再申訴事件之審議。
- 地方軍事法院得指定庭長兼任官兵權益保障會組長，監督並分配國防法務官審議復審及再申訴事件。
- 各級軍事法院及其分院辦理軍事審判案件、復審、再申訴或第一審行政訴訟事件事務，置書記官若干人，受軍事審判官或國防法務官之指揮監督，綜理記錄、編案、統計、文書等事務。
- 有二以上書記官時，以一人為主任書記官。
各級軍事法院及其分院得置通譯及執法官兵，其執行職務，受軍事審判官或國防法務官之指揮監督。
各級軍事法院及其分院各職稱之官階及員額，另以編組裝備表定之。
- 地方軍事法院及其分院審理軍事審判案件，以審判官一人獨任或三人合議行之。
- 高等軍事法院及其分院審理軍事審判案件，以審判官三人合議行之，其上校以上審判官不得少於二人。
- 高等軍事法院及其分院審理第一審行政訴訟事件，以軍事審判官三人合議行之。但簡易訴訟程序，得由軍事審判官一人獨任行之。
- 最高軍事法院審理軍事審判案件，以上校以上審判官五人合議行之。
- 合議審判以庭長充任審判長，無庭長或庭長有事故時，以庭員中階高資深者充任之。
- 獨任審判，以該軍事審判官行審判長之職權。
合議庭之組織，因軍事審判官迴避或其他原因致員額不足時，得報請上級軍事法院就同級軍事法院臨時調充之。
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