根據農地重劃條例第26條，土地所有權人對於重劃區土地的分配如果有異議，應在公告期間內以書面形式向該管直轄市或縣（市）主管機關提出異議。主管機關在接到異議後應進行調查處理。如果異議事項涉及他人權利，主管機關還應通知相關權利關係人進行調處。如果土地所有權人對主管機關的調處結果不滿意，應當場表示異議。經表示異議的調處案件，主管機關應在五天內將其報請上級機關裁決。如果在縣內設有農地重劃委員會或農地重劃協進會，則對於前述的調處案件，應先向農地重劃委員會或農地重劃協進會交付進行調解。 根據農地重劃條例施行細則第51條，如果重劃後實際分配的土地面積超過應分配的面積，縣（市）主管機關在重劃土地交接後應通知土地所有權人，要求其根據查定的重劃地價，在限期內支付差額地價；如果逾期未繳納，則可以根據民事訴訟法的督促程序規定，聲請法院以督促程序發出支付命令。而如果實際分配的土地面積小於應分配的面積，則應根據查定的重劃地價，發給差額地價作為補償。 以上解釋根據所提供的參考資料，包括農地重劃條例及其施行細則中相關的法條及解釋性函釋。參考資料中提到的案例及具體實例沒有提供，因此無法進一步分析。
土地所有權人對於重劃區土地之分配如有異議，應於公告期間向該管直轄市或縣（市）主管機關以書面提出，該管直轄市或縣（市）主管機關應予查處。其涉及他人權利者，並應通知其權利關係人予以調處。土地所有權人對主管機關之調處如有不服，應當場表示異議。經表示異議之調處案件，主管機關應於五日內報請上級機關裁決之。 在縣設有農地重劃委員會或農地重劃協進會者，前項調處案件，應先發交農地重劃委員會或農地重劃協進會予以調解。
立法理由一、重劃分配之土地，直接影響農民之利益，為重視農民權益，維持農村社會之安定，爰明定土地所有權人對土地之分配如有異議，應在公告期間內向該管主管機關提出異議，並規定該項異議之處理程序，以利執行。 二、為加速異議案件之處理，並積極為民服務，對於異議案件涉及他人權利者，直轄市或縣（市）主管機關應發交重劃區農地重劃協進會或直轄市或縣（市）農地重劃委員會予以調解，調解不成立時，應由直轄市或縣（市）主管機關予以調處，不服調處時，報由上級主管機關裁決之。
一、重劃分配之土地，直接影響農民之利益，為重視農民權益，維持農村社會之安定，爰明定土地所有權人對土地之分配如有異議，應在公告期間內向該管主管機關提出異議，並規定該項異議之處理程序，以利執行。 二、為加速異議案件之處理，並積極為民服務，對於異議案件涉及他人權利者，直轄市或縣（市）主管機關應發交重劃區農地重劃協進會或直轄市或縣（市）農地重劃委員會予以調解，調解不成立時，應由直轄市或縣（市）主管機關予以調處，不服調處時，報由上級主管機關裁決之。
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