本中心因業務必要使用改制前各機關原使用之公有不動產，得由該公有不動產之主管機關捐贈、出租或無償提供本中心使用；因業務必要使用之公有動產，得由監督機關捐贈本中心或無償提供使用；有價證券與其他之權利，得由監督機關捐贈本中心或無償提供使用；採捐贈者，不適用預算法第二十五條及第二十六條、國有財產法第二十八條及第六十條等相關規定。 本中心設立後，因業務需要得價購公有不動產。土地之價款，以當期公告土地現值為準。地上建築改良物之價款，以稅捐稽徵機關提供之當年期評定現值為準；無該當年期評定現值者，依公產管理機關估價結果為準。 本中心以政府機關核撥經費指定用途所購置之財產，為公有財產。 第一項出租、無償提供使用及前項之公有財產以外，由本中心取得之財產為自有財產。 第一項無償提供使用及第三項之公有財產，以本中心為管理人，所生之收益，列為本中心之收入，不受國有財產法第七條第一項規定之限制；其管理、使用、收益等相關事項之辦法，由監督機關定之。 公有財產用途廢止時，應移交各級政府公產管理機關接管。 本中心接受捐贈之公有不動產，不需使用時，應歸還原捐贈機關，不得任意處分。
根據國家資通安全科技中心設置條例第27條，該中心可以在業務需要時，由相關的公有不動產主管機關提供捐贈、出租或無償提供使用。同樣地，對於業務需要的公有動產，可以由監督機關捐贈或無償提供使用。此外，有價證券和其他權利也可以由監督機關捐贈或無償提供使用。由於這些是捐贈的財產，所以不適用預算法和國有財產法的相關規定。 在成立中心後，若在業務需要下，可以以價格購買公有不動產，土地的價款以當期公告土地現值為準。而地上建築物的價款則以稅捐稽徵機關提供的評定現值為基準，若當年期沒有評定現值，則以公產管理機關的估價結果為準。 在第一項已提到的出租、無償提供使用以外，本中心取得的財產為自有財產。對於第一項的無償提供使用和第三項的公有財產，本中心作為管理人，所產生的收益列為本中心的收入，並不受國有財產法的限制。有關其管理、使用、收益等事項的辦法由監督機關制定。 當公有財產的用途被廢止時，應該將其移交給相應層級政府的公產管理機關接管。對於接受捐贈的公有不動產，如果不需要使用，應該歸還給原來的捐贈機關，且不能隨意處分。
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