局長綜理局務，並指揮監督所屬單位及人員，其權責如下：
一、工作計畫之決定、變更及考核事項。
二、預算之審核、流用、追加 (減) 及預備金之動支事項。
三、上級重要命令之執行事項。
四、向上級建議、請示、申復或報告事項。
五、指揮監督所屬各單位之工作事項。
六、臨時發生重大案件之緊急措施事項。
七、所屬人員之依法任免、遷調、獎懲事項。
八、主持或參加各種重要會議事項。
九、其他有關重要事務之決定或處理事項。
內政部警政署水上警察局辦事細則 第三章 權責
§ 18–26共 9 條
副局長襄助局長處理局務，其權責如下：
一、襄助局長處理公務事項。
二、局長差假時，其職務之代行 (理) 事項。
三、重要局務之參與及擬議事項。
四、業務之監督及指導事項。
五、主持或參加各種會議事項。
六、計畫方案及重大決策之研議事項。
七、局長交辦事項。
主任秘書承局長、副局長之命指導本局各單位業務，並處理公務，其權責如下：
一、重大局務之建議事項。
二、各單位業務之協調及督導事項。
三、各單位文稿之綜核及文書處理之督導事項。
四、業務研究發展及管制考核之策劃督導事項。
五、機要文電處理事項。
六、局長、副局長交辦事項。
技正、研究員承長官之命，處理公務，其權責如下：
一、襄助長官處理公務事項。
二、重要方案之設計審議事項。
三、技術性及專門性問題之研究審議事項。
四、業務改進之建議事項。
五、長官交辦事項。
科、室、中心主管、刑事警察隊隊長承局長、副局長之命，主任秘書之指導，處理公務，其權責如下：
一、主管業務之策劃、督導、改進事項。
二、所屬人員執行任務之監督、指導、審核事項。
三、所屬人員工作分配、監督、考核及獎懲之擬議事項。
四、依照本局分層負責明細表之規定代行裁決事項。
五、重要公文之擬辦事項。
六、局長、副局長交辦事項。
隊長之權責如下：
一、所屬員警工作分配、監督、考核及勤務執行事項。
二、人事遷調、獎懲按授權規定之決定或擬議事項。
三、隊務之推行及改進事項。
四、所屬員警之管理及教育訓練事項。
五、臨時緊急事故之處理事項。
六、上級交辦事項。
副隊長之權責如下：
一、襄助隊長處理隊務事項。
二、隊長差假時，其職務之代行 (理) 事項。
三、長官交辦及其他授權處理事項。
分隊長之權責如下：
一、所屬員警工作之分配、監督及考核及勤務執行事項。
二、所屬員警之管理、教育及訓練事項。
三、臨時緊急事故之處理事項。
四、長官交辦及其他授權處理事項。
秘書、督察、刑事警察隊副隊長、直屬船隊副隊長、股長、組長、督察員、科員、組員、技士、技佐、偵查員、小隊長、警務佐、辦事員、隊員及書記，承長官之命處理應辦事項。
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