本條例第三十八條第一項第一款所稱「所得稅」，包括因合併清算發生之所得稅在內；其免徵，免辦清算所得申報。 本條例第三十八條第一項第二款記存之土地增值稅，於合併後之生產事業移轉該土地時，與該次移轉之土地增值稅分別計算，一併繳納。
根據獎勵投資條例施行細則第63條的規定，本條例第38條第1項第1款所稱「所得稅」，包括因合併清算發生之所得稅。這表示在合併清算時產生的所得稅在免徵範圍內。此外，第38條第1項第2款規定，記存之土地增值稅在合併後生產事業移轉該土地時，應分別計算其土地增值稅並一併繳納。 舉例來說，假設一家公司進行了合併清算，清算過程中產生了所得稅。根據獎勵投資條例施行細則第63條的規定，這部分所得稅可以免徵，不需要申報。另外，如果在合併後，生產事業將土地轉移並產生土地增值稅，根據同一法規，應分別計算每次土地增值稅並一併繳納。
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