刑事訴訟法第379條規定：有左列情形之一者，其判決當然違背法令︰一、法院之組織不合法者。二、依法律或裁判應迴避之法官參與審判者。三、禁止審判公開非依法律之規定者。四、法院所認管轄之有無係不當者。五、法院受理訴訟或不受理訴訟係不當者。六、除有特別規定外，被告未於審判期日到庭而逕行審判者。七、依本法應用辯護人之案件或已經指定辯護人之案件，辯護人未經到庭 辯護而逕行審判者。八、除有特別規定外，未經檢察官或自訴人到庭陳述而為審判者。九、依本法應停止或更新審判而未經停止或更新者。十、依本法應於審判期日調查之證據而未予調查者。十一、未與被告以最後陳述之機會者。十二、除本法有特別規定外，已受請求之事項未予判決，或未受請求之事項予以判決者。十三、未經參與審理之法官參與判決者。十四、判決不載理由或所載理由矛盾者。此種情形，不論對判決有無影響，即可直接上訴。

制定法律的憲法機關。依憲法第62條規定，立法院為國家最高立法機關，由人民選舉的立法委員組織，代表人民行使立法權。故立法院是我國制定法律的憲法機關。

行政訴訟法第162條規定，行政法院認有必要時，得就訴訟事件的專業法律問題，徵詢從事該學術研究的人（行政法院組織法第15條之8、法院組織法第7條之4亦有類似規定）。專家學者就專業法律問題以書面提出其法律上的意見，該書面即屬法律意見書。

因專利法而提起的行政訴訟事件（智慧財產法院組織法第3條第3款規定）。 例如：甲主張乙的發明專利不具進步性，向經濟部智慧財產局（下稱智慧局）提起舉發，對於智慧局所為舉發成立或不成立的審定，經訴願程序後，向智慧財產法院提起行政訴訟，這個案件即專利行政訴訟事件。

法院審判案件的組織，如果只有法官一人，就叫做獨任審判。例如地方法院簡易庭的案件是由一個法官進行審判。

為確保裁判的公正性，提供一般國民了解及監督法庭程序之機會，進而促進國民對法庭程序公正性的信賴，除有其他涉及當事人隱私或有不適於公開的情形外（例如：法院組織法第86條但書、民事訴訟法第195條之1、家事事件法第9條第1項前段等），原則上訴訟的審理與裁判均應於一般公眾均可自由旁聽的情形下進行。

法院組織法第3條規定法院審判案件之組織可分為「獨任制」和「合議制」。獨任制以一位法官獨任審理，合議制則為依訴訟法或其他法律規定有三人以上之法官共同審理訴訟案件，此時所組成者為「合議庭」。在地方法院及高等法院合議庭均由三位法官組成；最高法院則由五位法官合議。

依法院組織法第10條規定，地方法院得設簡易庭，受理民事簡易事件、刑事簡易案件及社會秩序維護法案件。其中民事簡易事件可分為小額訴訟事件及簡易訴訟事件，前者之訴訟標的金額或價額在新臺幣10萬元以下，後者則包括新臺幣50萬元以下及其他法定訴訟類型。

審判機關和檢察機關各自獨立，互不相隸屬，法院行使國家的司法權，於行政組織上隸屬於司法院，而檢察機關在行政組織的架構上則隸屬於法務部，是屬於行政院轄下的一員，雙方在行政作用上不能互相干涉。

上訴於第三審法院，非以判決違背法令為理由，不得為之。(刑事訴訟法第379條規定：有左列情形之一者，其判決當然違背法令︰一、法院之組織不合法者。二、依法律或裁判應迴避之法官參與審判者。三、禁止審判公開非依法律之規定者。四、法院所認管轄之有無係不當者。五、法院受理訴訟或不受理訴訟係不當者。六、除有特別規定外，被告未於審判期日到庭而逕行審判者。七、依本法應用辯護人之案件或已經指定辯護人之案件，辯護人未經到庭辯護而逕行審判者。八、除有特別規定外，未經檢察官或自訴人到庭陳述而為審判者。九、依本法應停止或更新審判而未經停止或更新者。十、依本法應於審判期日調查之證據而未予調查者。十一、未與被告以最後陳述之機會者。十二、除本法有特別規定外，已受請求之事項未予判決，或未受請求之事項予以判決者。十三、未經參與審理之法官參與判決者。十四、判決不載理由或所載理由矛盾者。)